La villa è stata acquistata dal Comune di Saronno dalla famiglia Gianetti nel 1923 per essere destinata a municipio. La funzione di sede degli uffici comunali terminò nel 1985.

La villa, immersa in un ampio giardino, è di stile neorinascimentale e conserva decorazioni, alcune tele di valore artistico, un colonnato e un patio. All’ingresso del portico vi è una riproduzione della Madonna del Lippi dipinta dai pittori lombardi Bonatti e Chiesa.

Il santuario venne eretto nel 1498 dal popolo di Saronno per dare ospitalità al simulacro della Madonna del miracolo, una statua della seconda metà del XIV secolo, posta allora in una cappella sulla strada Varesina, ritenuta dispensatrice di miracolose guarigioni. Il territorio lombardo si arricchiva così di un nuovo santuario mariano che divenne presto meta importante di devozionalità e che si arricchì con il tempo di formidabili tesori d’arte.

Il 2 gennaio 1923 papa Pio XI elevò il Santuario al rango di basilica romana minore.

La collezione e la Villa sono donazioni fatte dalle famiglie Gianetti-Biffi alla Fondazione COE (Centro Orientamento Educativo). Della villa d’epoca si conserva inalterata la struttura e l’arredamento. Degni di nota sono la ringhiera della scalinata che conduce al secondo piano del Museo, realizzata a mano, i lampadari in vetro di Murano, gli elaborati pavimenti in parquet. Fruibile è anche il giardino che circonda il Museo con il suo piccolo roseto e le installazioni d’arte contemporanea.

Il museo accoglie 200 opere provenienti da Meissen in Germania, la prima manifattura a produrre porcellana in Europa. Ospita inoltre porcellane italiane, europee ed orientali. Tra le manifatture italiane spiccano quelle di Hewelcke, Vezzi, Ginori, Capodimonte.

È presente una sezione dedicata alle maioliche “fini” italiane ed europee, composta soprattutto da pezzi provenienti dal nord Italia. Un’ulteriore sezione è quella della ceramica contemporanea, costituita grazie alle donazioni di diversi artisti che hanno esposto nel museo o che hanno vinto il CoffeeBreak.museum, concorso biennale dedicato ai giovani artisti che lavorano con la ceramica. Nel 2015 è stata inaugurata la collezione del Professor Aldo Marcenaro (1931-2011), i suoi 24 pezzi sono andati ad integrare il percorso filologico, stilistico e storico della collezione di Gianetti.